男宝宝尿尿比较频繁，甚至妈妈给他换尿布的时候也会尿尿，容易发生臀部肿痛，因此男婴的臀部及生殖器周围的清洗工作也是很有必要的。男婴的清洁工作通常也是在换尿布的时候。在打开尿布的时候，妈妈要记得不要急着拿掉尿布，而是让宝宝的阴茎裸露几秒钟，因为调皮的男宝宝很可能这个时候又要撒尿。
如果尿布上有粪便，妈妈要先用旧尿布将粪便擦净。如果没有，则直接用婴儿专用湿巾将宝宝的小屁股擦洗一遍。如果室内不太冷的话，妈妈也可顺便将宝宝的小腹也擦洗一下，当是给宝宝进行腹部按摩了。
男婴清洁工作的重点在于阴茎。妈妈要用蘸取了温水的药棉清洗宝宝阴茎部的皮肤褶皱，记得顺序是由上到下。注意在清洁的时候，记得不要拉扯宝宝的阴茎包皮。也不要将包皮往上推，只清洁包皮下面的阴茎本身即可。
然后是清洁宝宝的睾丸及阴囊周围。当清洁宝宝睾丸下面时，记得用手指将睾丸往上托住，而不是往上拉阴茎。清洁的时候要仔细，因为这里很可能滞留有尿渍或大便。若万一需要向上拉宝宝的阴茎，动作一定要轻柔，不要拉扯阴茎皮肤，否则不小心弄痛宝宝的话，宝宝从此将不喜欢清洁。
接着清洗宝宝的肛门和小屁股。妈妈可以举起宝宝的双腿，一只手握住他的脚踝，另一只手擦拭宝宝的肛门和小屁股，记得连大腿的根部也一并擦拭。
最后，在宝宝阴茎以上的部位、睾丸附近及肛门、臀部等部位涂抹一层婴儿油。如果宝宝有尿布疹的话，则要涂抹紫药水，并且涂抹完毕后不要急着更换新的尿布，而是让宝宝光着屁股玩一会儿，然后再用新的尿布包起来，穿好衣服。
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